Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shank3Q4ACU6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Shank3Q4ACU6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms