Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Snx25Q3ZT31 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Snx25Q3ZT31 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Snx25Q3ZT31 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Snx25Q3ZT31 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Snx25Q3ZT31 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Snx25Q3ZT31 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Snx25Q3ZT31 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Snx25Q3ZT31 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Snx25Q3ZT31 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Snx25Q3ZT31 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx25Q3ZT31 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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