Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Carmil2Q3V3V9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Carmil2Q3V3V9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms