Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmub2Q3V209 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmub2Q3V209 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms