Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ulk4Q3V129 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk4Q3V129 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms