Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b4Q3V0X2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms