Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm906Q3V0M1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm906Q3V0M1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms