Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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Usp48Q3V0C5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp48Q3V0C5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp48Q3V0C5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp48Q3V0C5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp48Q3V0C5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Usp48Q3V0C5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Usp48Q3V0C5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp48Q3V0C5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Usp48Q3V0C5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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Usp48Q3V0C5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms