Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube2fbQ3UWQ3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms