Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clca4bQ3UW98 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clca4bQ3UW98 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms