Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn13Q3UW68 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms