Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pate2Q3UW31 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms