Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defb48Q3UW22 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Defb48Q3UW22 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defb48Q3UW22 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defb48Q3UW22 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defb48Q3UW22 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defb48Q3UW22 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Defb48Q3UW22 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Defb48Q3UW22 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defb48Q3UW22 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms