Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn4Q3UV66 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slfn4Q3UV66 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms