Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm10Q3UTQ7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm10Q3UTQ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm10Q3UTQ7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm10Q3UTQ7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm10Q3UTQ7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm10Q3UTQ7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm10Q3UTQ7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm10Q3UTQ7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm10Q3UTQ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm10Q3UTQ7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm10Q3UTQ7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms