Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm6899Q3USS0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6899Q3USS0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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