Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fchsd2Q3USJ8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms