Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbm20Q3UQS8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbm20Q3UQS8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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