Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skap2Q3UND0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skap2Q3UND0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms