Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc33Q3ULW6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms