Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc106Q3ULM0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms