Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms