Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp19Q3UJD6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms