Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edc4Q3UJB9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edc4Q3UJB9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms