Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf224Q3UIW8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms