Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc34Q3UI66 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc34Q3UI66 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms