Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Greb1Q3UHK3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms