Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf44Q3UHJ8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf44Q3UHJ8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms