Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccser2Q3UHI0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser2Q3UHI0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms