Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms