Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Puf60Q3UEB3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms