Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trafd1Q3UDK1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms