Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kdm4dQ3U2K5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kdm4dQ3U2K5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms