Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf6Q3TWW8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms