Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd4Q3TT99 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gdpd4Q3TT99 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd4Q3TT99 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms