Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3TQQ9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3TQQ9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms