Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms