Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Stt3bQ3TDQ1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stt3bQ3TDQ1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Stt3bQ3TDQ1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Stt3bQ3TDQ1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Stt3bQ3TDQ1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Stt3bQ3TDQ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Stt3bQ3TDQ1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms