Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Jmjd8Q3TA59 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms