Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrriq1Q0P5X1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms