Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Neurl1bQ0MW30 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Neurl1bQ0MW30 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 331.1 ms