Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms