Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms