Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pou6f1Q07916 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms