Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ebf1Q07802 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ebf1Q07802 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms