Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah1bQ06985 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms