Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a1Q05722 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms