Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top1Q04750 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms