Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nf1Q04690 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms