Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epha4Q03137 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms